Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC9P31274 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC9P31274 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC9P31274 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC9P31274 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC9P31274 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC9P31274 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC9P31274 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms