Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms