Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms