Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms