Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGR1P18146 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms