Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms