Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms