Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEFHP12036 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEFHP12036 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFHP12036 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEFHP12036 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEFHP12036 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEFHP12036 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFHP12036 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms