Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV1-8P0DP01 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms