Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP4O95707 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP4O95707 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP4O95707 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP4O95707 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP4O95707 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms