Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD4O95243 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD4O95243 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms