Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPLO60437 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPLO60437 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPLO60437 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPLO60437 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPLO60437 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPLO60437 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPLO60437 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPLO60437 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPLO60437 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPLO60437 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPLO60437 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPLO60437 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPLO60437 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms