Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP104O60308 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP104O60308 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP104O60308 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP104O60308 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP104O60308 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms