Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SPAG9O60271 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPAG9O60271 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
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