Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms