Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
U2SURPO15042 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27■■□□□ 1.91
U2SURPO15042 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms