Protein–RNA interactions for Protein: A6NC62

RBAKDN, Putative RBAK downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKDNA6NC62 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBAKDNA6NC62 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms