Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC233724.3-201ENST00000512613 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 IGKV2D-18-201ENST00000519785 375 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC01300-202ENST00000521073 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR1D4-201ENST00000525719 939 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC027779.1-201ENST00000530492 516 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TMEM107-209ENST00000533070 726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC140658.1-201ENST00000563019 346 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR1D5-201ENST00000575751 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CD160-204ENST00000584442 219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SCGB2B3P-201ENST00000599388 409 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ARMCX7P-202ENST00000602449 655 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC107294.2-201ENST00000610001 701 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC009237.16-201ENST00000612987 506 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC004678.1-201ENST00000615016 929 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FTX_5.1-201ENST00000618701 218 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AP001206.1-201ENST00000635554 720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RETNLB-201ENST00000295755 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 LAIR2-202ENST00000351841 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 GLRX3P2-201ENST00000405027 1038 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 DCD-202ENST00000456047 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 SETP16-201ENST00000531054 711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC02548-201ENST00000531749 484 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 AL392023.1-201ENST00000555655 531 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 RN7SL140P-201ENST00000581321 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC013290.1-201ENST00000586960 537 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HDAC1P2-202ENST00000602936 807 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.98-201ENST00000610878 274 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL354740.1-202ENST00000612837 290 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 EHHADH-AS1-201ENST00000417720 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 EXOSC9-211ENST00000512454 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PSG11-202ENST00000320078 1575 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GLT8D2-202ENST00000546436 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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