Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN11Q9UMQ6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms