Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms