Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX20Q9UHI6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms