Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms