Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDT1Q9H211 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms