Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX4Q9H1E5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX4Q9H1E5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms