Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG9Q9H0W8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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