Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms