Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCMBPQ9BTE3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms