Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN18Q96SJ8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms