Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms