Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms