Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms