Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms