Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP13Q86W25 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP13Q86W25 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms