Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC8Q6A555 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TXNDC8Q6A555 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms