Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CC2D1BQ5T0F9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms