Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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