Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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