Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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