Protein–RNA interactions for Protein: Q12308

TFC8, Transcription factor tau 60 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC8Q12308 APC1YNL172W 5247 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 FRT2YAL028W 1587 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 NUP2YLR335W 2163 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 LSO2YGR169C-A 279 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 PHD1YKL043W 1101 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 NAT1YDL040C 2565 nt5.17□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 AI2Q0055 2565 nt5.16□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 SEC63YOR254C 1992 nt5.15□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 BBC1YJL020C 3474 nt5.15□□□□□ -1.58
TFC8Q12308 COX5BYIL111W 456 nt5.15□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 TAF6YGL112C 1551 nt5.15□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 YDL176WYDL176W 2127 nt5.15□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 TGL4YKR089C 2733 nt5.15□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 NPR1YNL183C 2373 nt5.14□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.14□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.14□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.14□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 FIG4YNL325C 2640 nt5.14□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 VHC1YBR235W 3363 nt5.13□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 SIP3YNL257C 3690 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 KGD1YIL125W 3045 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 LYP1YNL268W 1836 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 YFL065CYFL065C 309 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 YPR203WYPR203W 309 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 snR53snR53 91 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 APL5YPL195W 2799 nt5.12□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 MDR1YGR100W 2853 nt5.11□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 GIN4YDR507C 3429 nt5.11□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 AKL1YBR059C 3327 nt5.1□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 PEP3YLR148W 2757 nt5.1□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 RIM15YFL033C 5313 nt5.1□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 ROG1YGL144C 2058 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 DUF1YOL087C 3351 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 GLT1YDL171C 6438 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 FOX2YKR009C 2703 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 YDR193WYDR193W 399 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 RCO1YMR075W 2055 nt5.09□□□□□ -1.59
TFC8Q12308 GIS4YML006C 2325 nt5.08□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt5.08□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt5.08□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 ADP1YCR011C 3150 nt5.08□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 VPH1YOR270C 2523 nt5.08□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 YGR125WYGR125W 3111 nt5.08□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 PBY1YBR094W 2262 nt5.07□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 RPS17BYDR447C 411 nt5.06□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 NUP85YJR042W 2235 nt5.06□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 SKG6YHR149C 2205 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 MSH2YOL090W 2895 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 SNA2YDR525W-A 240 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.05□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 PUF4YGL014W 2667 nt5.04□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 ERB1YMR049C 2424 nt5.04□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 GIS1YDR096W 2685 nt5.03□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 PDR12YPL058C 4536 nt5.03□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 VMA9YCL005W-A 222 nt5.03□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 GPR1YDL035C 2886 nt5.03□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 YOR1YGR281W 4434 nt5.03□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 SWI3YJL176C 2478 nt5.03□□□□□ -1.6
TFC8Q12308 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt5.02□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 DYN2YDR424C 279 nt5.02□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.02□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 VID27YNL212W 2349 nt5.02□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 AIM44YPL158C 2277 nt5.01□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 FLO8YER109C 2400 nt5.01□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 CHS6YJL099W 2241 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 ATG13YPR185W 2217 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 ZDS1YMR273C 2748 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 FZO1YBR179C 2568 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 RFX1YLR176C 2436 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 SMT3YDR510W 306 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 LYS14YDR034C 2373 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 PAN1YIR006C 4443 nt5□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 IOC2YLR095C 2439 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 MSD1YPL104W 1977 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 BCH1YMR237W 2175 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 PDR15YDR406W 4590 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 RAD16YBR114W 2373 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt4.99□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 SPO75YLL005C 2607 nt4.98□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 COA3YJL062W-A 258 nt4.98□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 GAL4YPL248C 2646 nt4.98□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 RIA1YNL163C 3333 nt4.97□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 DNF2YDR093W 4839 nt4.97□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 EDS1YBR033W 2760 nt4.97□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 SLM2YNL047C 1971 nt4.96□□□□□ -1.61
TFC8Q12308 VHS3YOR054C 2025 nt4.96□□□□□ -1.62
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