Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms