Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms