Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms