Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms