Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTBP2P56545 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms