Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA1P56159 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms