Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms