Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBRP36941 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBRP36941 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBRP36941 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms