Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT9P35527 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT9P35527 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT9P35527 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT9P35527 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT9P35527 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT9P35527 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT9P35527 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms