Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKBRP32239 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKBRP32239 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKBRP32239 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKBRP32239 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKBRP32239 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms