Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms